По умолчанию сервер Kaspersky Security Center настроен так, чтобы удалять компьютеры, которые давно не появлялись в сети. Сделано это для того, чтобы не захламлять список подключенных к серверу устройств. Для изменения этой настройки щелкните правой кнопкой мыши по управляемым устройствам и откройте Свойства.
В разделе Устройства найдите параметр Удалять устройство из группы, если оно неактивно больше (сут). Вы можете изменить срок, после которого неактивные устройства будут удаляться, или отключить параметр вовсе.
Отмечу, что срок до удаления можно настраивать для различных групп устройств индивидуально. Для этого параметр Наследовать из родительской группы должен быть выключен.
P.S. А если у вас пропадают устройства с сервера WSUS, возможно, вам поможет статья по этой ссылке.